El Colegio José María Berrio cuenta con una amplia infraestructura diseñada para satisfacer las necesidades de sus estudiantes y familias. Entre las instalaciones se encuentran un auditorio, biblioteca, coliseo, muro de escalar, parques infantiles, huerta, granja, y aulas equipadas con televisión, computadoras y video beam. Además, cuenta con canchas sintéticas de baloncesto y microfútbol, así como un Ecoparque Natura (Granja) para actividades al aire libre.